MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Glaciecola nitratireducens FR1064 chromosome

Total Repeats: 70771

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016041	AGA	2	6	35	40	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027468
2	NC_016041	CAA	2	6	118	123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348027468
3	NC_016041	TTA	3	9	214	222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348027468
4	NC_016041	AAC	2	6	252	257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348027468
5	NC_016041	GCA	2	6	260	265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348027468
6	NC_016041	AAC	2	6	294	299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348027468
7	NC_016041	AGAT	2	8	308	315	50 %	25 %	25 %	0 %	348027468
8	NC_016041	AACAA	2	10	364	373	80 %	0 %	0 %	20 %	348027468
9	NC_016041	ACA	2	6	397	402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348027468
10	NC_016041	TGG	2	6	419	424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348027468
11	NC_016041	ACG	2	6	472	477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348027468
12	NC_016041	TAA	2	6	500	505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348027468
13	NC_016041	CTA	2	6	577	582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348027468
14	NC_016041	GGT	2	6	609	614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348027468
15	NC_016041	AGC	2	6	634	639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348027468
16	NC_016041	GCTC	2	8	648	655	0 %	25 %	25 %	50 %	348027468
17	NC_016041	TGG	2	6	668	673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348027468
18	NC_016041	TCA	2	6	692	697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348027468
19	NC_016041	AAG	2	6	703	708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027468
20	NC_016041	AAT	2	6	732	737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348027468
21	NC_016041	TTG	2	6	850	855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348027468
22	NC_016041	TAA	2	6	902	907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348027468
23	NC_016041	TGG	2	6	941	946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348027468
24	NC_016041	TAA	2	6	1001	1006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348027468
25	NC_016041	AGA	2	6	1085	1090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027468
26	NC_016041	TCGG	2	8	1106	1113	0 %	25 %	50 %	25 %	348027468
27	NC_016041	CTG	2	6	1122	1127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348027468
28	NC_016041	AAG	2	6	1168	1173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027468
29	NC_016041	T	6	6	1176	1181	0 %	100 %	0 %	0 %	348027468
30	NC_016041	ATT	2	6	1218	1223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348027468
31	NC_016041	GTT	2	6	1302	1307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348027468
32	NC_016041	CCT	2	6	1314	1319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	348027468
33	NC_016041	TGA	2	6	1345	1350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348027468
34	NC_016041	AGTT	2	8	1543	1550	25 %	50 %	25 %	0 %	348027468
35	NC_016041	ATT	2	6	1582	1587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348027468
36	NC_016041	GTT	2	6	1758	1763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348027468
37	NC_016041	AGA	2	6	1793	1798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027468
38	NC_016041	TAA	2	6	1810	1815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348027468
39	NC_016041	TAA	2	6	1830	1835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348027468
40	NC_016041	TTA	2	6	1882	1887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348027469
41	NC_016041	ACG	2	6	1920	1925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348027469
42	NC_016041	CA	3	6	1927	1932	50 %	0 %	0 %	50 %	348027469
43	NC_016041	A	6	6	2071	2076	100 %	0 %	0 %	0 %	348027469
44	NC_016041	ATC	2	6	2086	2091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348027469
45	NC_016041	GCGA	2	8	2191	2198	25 %	0 %	50 %	25 %	348027469
46	NC_016041	A	6	6	2273	2278	100 %	0 %	0 %	0 %	348027469
47	NC_016041	GCA	2	6	2295	2300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348027469
48	NC_016041	TTA	2	6	2310	2315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348027469
49	NC_016041	GAA	2	6	2341	2346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027469
50	NC_016041	TTA	2	6	2351	2356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348027469
51	NC_016041	GCT	2	6	2410	2415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348027469
52	NC_016041	GC	3	6	2425	2430	0 %	0 %	50 %	50 %	348027469
53	NC_016041	TTA	2	6	2435	2440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348027469
54	NC_016041	AAT	2	6	2463	2468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348027469
55	NC_016041	GTA	2	6	2513	2518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348027469
56	NC_016041	AGA	2	6	2590	2595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027469
57	NC_016041	CG	3	6	2633	2638	0 %	0 %	50 %	50 %	348027469
58	NC_016041	AGAGCA	2	12	2748	2759	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	348027469
59	NC_016041	TAG	2	6	2771	2776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348027469
60	NC_016041	CTTAT	2	10	2822	2831	20 %	60 %	0 %	20 %	348027469
61	NC_016041	TCA	2	6	2936	2941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348027469
62	NC_016041	ATT	3	9	2958	2966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348027469
63	NC_016041	ATCT	2	8	2991	2998	25 %	50 %	0 %	25 %	348027470
64	NC_016041	ATC	2	6	3065	3070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348027470
65	NC_016041	ATC	2	6	3094	3099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348027470
66	NC_016041	AC	3	6	3172	3177	50 %	0 %	0 %	50 %	348027470
67	NC_016041	TTGA	2	8	3206	3213	25 %	50 %	25 %	0 %	348027470
68	NC_016041	A	6	6	3231	3236	100 %	0 %	0 %	0 %	348027470
69	NC_016041	GA	4	8	3285	3292	50 %	0 %	50 %	0 %	348027470
70	NC_016041	AAG	2	6	3296	3301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027470
71	NC_016041	AGT	2	6	3350	3355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348027470
72	NC_016041	TTG	2	6	3393	3398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348027470
73	NC_016041	CT	3	6	3461	3466	0 %	50 %	0 %	50 %	348027470
74	NC_016041	ATT	2	6	3478	3483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348027470
75	NC_016041	GCA	2	6	3596	3601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348027470
76	NC_016041	AGT	2	6	3613	3618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348027470
77	NC_016041	CTGG	2	8	3672	3679	0 %	25 %	50 %	25 %	348027470
78	NC_016041	AGA	2	6	3697	3702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027470
79	NC_016041	TTC	2	6	3874	3879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348027470
80	NC_016041	CTAT	2	8	3897	3904	25 %	50 %	0 %	25 %	348027470
81	NC_016041	TGA	2	6	3910	3915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348027470
82	NC_016041	T	6	6	3952	3957	0 %	100 %	0 %	0 %	348027470
83	NC_016041	AAAT	2	8	4027	4034	75 %	25 %	0 %	0 %	348027470
84	NC_016041	A	6	6	4043	4048	100 %	0 %	0 %	0 %	348027470
85	NC_016041	GAG	2	6	4079	4084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348027470
86	NC_016041	A	6	6	4086	4091	100 %	0 %	0 %	0 %	348027470
87	NC_016041	AGA	2	6	4096	4101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027471
88	NC_016041	TTC	2	6	4111	4116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348027471
89	NC_016041	GTT	2	6	4220	4225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348027471
90	NC_016041	TGA	2	6	4237	4242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348027471
91	NC_016041	GAA	3	9	4343	4351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027471
92	NC_016041	CAG	2	6	4359	4364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348027471
93	NC_016041	TTA	2	6	4371	4376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348027471
94	NC_016041	A	7	7	4474	4480	100 %	0 %	0 %	0 %	348027471
95	NC_016041	CGT	2	6	4496	4501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348027471
96	NC_016041	ACA	2	6	4586	4591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348027471
97	NC_016041	GAA	2	6	4610	4615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027471
98	NC_016041	ATC	2	6	4697	4702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348027471
99	NC_016041	CAA	2	6	4783	4788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348027471
100	NC_016041	AGT	2	6	4792	4797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348027471
101	NC_016041	ATA	2	6	4905	4910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348027471
102	NC_016041	TGG	2	6	4924	4929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348027471
103	NC_016041	AAG	2	6	5003	5008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027471
104	NC_016041	GCG	2	6	5025	5030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348027471
105	NC_016041	ACG	2	6	5031	5036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348027471
106	NC_016041	TCA	2	6	5090	5095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348027471
107	NC_016041	TCT	2	6	5117	5122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348027471
108	NC_016041	GAAGT	2	10	5123	5132	40 %	20 %	40 %	0 %	348027471
109	NC_016041	AAC	2	6	5157	5162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348027471
110	NC_016041	ACT	2	6	5169	5174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348027471
111	NC_016041	TTG	2	6	5205	5210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348027471
112	NC_016041	ATT	2	6	5216	5221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348027471
113	NC_016041	CG	3	6	5245	5250	0 %	0 %	50 %	50 %	348027471
114	NC_016041	TA	4	8	5352	5359	50 %	50 %	0 %	0 %	348027471
115	NC_016041	CTG	2	6	5373	5378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348027471
116	NC_016041	A	6	6	5407	5412	100 %	0 %	0 %	0 %	348027471
117	NC_016041	TCT	2	6	5480	5485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348027471
118	NC_016041	AAG	2	6	5487	5492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027471
119	NC_016041	TTA	2	6	5502	5507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348027471
120	NC_016041	ATT	3	9	5570	5578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348027471
121	NC_016041	CTGATG	2	12	5583	5594	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	348027471
122	NC_016041	TTC	3	9	5630	5638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348027471
123	NC_016041	TTGA	2	8	5654	5661	25 %	50 %	25 %	0 %	348027471
124	NC_016041	TTATAT	2	12	5668	5679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348027471
125	NC_016041	CCG	2	6	5687	5692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348027471
126	NC_016041	AAAG	2	8	5704	5711	75 %	0 %	25 %	0 %	348027471
127	NC_016041	GAT	2	6	5735	5740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348027471
128	NC_016041	TTA	2	6	5757	5762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348027471
129	NC_016041	AG	3	6	5819	5824	50 %	0 %	50 %	0 %	348027471
130	NC_016041	CAG	2	6	5875	5880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348027471
131	NC_016041	AGA	2	6	5888	5893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027471
132	NC_016041	GAAC	2	8	6067	6074	50 %	0 %	25 %	25 %	348027471
133	NC_016041	GAA	2	6	6194	6199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027471
134	NC_016041	GTG	2	6	6216	6221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348027471
135	NC_016041	GAA	2	6	6248	6253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027471
136	NC_016041	TTTGG	2	10	6256	6265	0 %	60 %	40 %	0 %	348027471
137	NC_016041	AAG	2	6	6273	6278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027471
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139	NC_016041	AGC	2	6	6333	6338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348027471
140	NC_016041	ATT	2	6	6415	6420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348027471
141	NC_016041	TGGTTT	2	12	7033	7044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348027472
142	NC_016041	ACA	2	6	7084	7089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348027472
143	NC_016041	GCAT	2	8	7137	7144	25 %	25 %	25 %	25 %	348027472
144	NC_016041	ACTA	2	8	7161	7168	50 %	25 %	0 %	25 %	348027473
145	NC_016041	TCA	2	6	7171	7176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348027473
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147	NC_016041	ATT	2	6	7296	7301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348027473
148	NC_016041	AT	3	6	7307	7312	50 %	50 %	0 %	0 %	348027474
149	NC_016041	AAACAT	2	12	7320	7331	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	348027474
150	NC_016041	GCT	2	6	7365	7370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348027474
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152	NC_016041	AC	3	6	7577	7582	50 %	0 %	0 %	50 %	348027474
153	NC_016041	AAT	2	6	7762	7767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348027475
154	NC_016041	CAA	2	6	7781	7786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348027475
155	NC_016041	GATTT	2	10	7796	7805	20 %	60 %	20 %	0 %	348027475
156	NC_016041	TCA	2	6	7813	7818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348027475
157	NC_016041	CAT	2	6	7835	7840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348027475
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159	NC_016041	ACG	2	6	7877	7882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348027475
160	NC_016041	AATATC	2	12	8013	8024	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	348027475
161	NC_016041	AT	3	6	8036	8041	50 %	50 %	0 %	0 %	348027475
162	NC_016041	GTTT	2	8	8051	8058	0 %	75 %	25 %	0 %	348027475
163	NC_016041	GC	3	6	8115	8120	0 %	0 %	50 %	50 %	348027475
164	NC_016041	GTT	2	6	8137	8142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348027475
165	NC_016041	GCT	2	6	8144	8149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348027475
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168	NC_016041	TAA	2	6	8217	8222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348027475
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170	NC_016041	ACG	2	6	8281	8286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348027475
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173	NC_016041	TA	3	6	8451	8456	50 %	50 %	0 %	0 %	348027475
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179	NC_016041	TCT	2	6	8786	8791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348027475
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247	NC_016041	TTTC	2	8	12880	12887	0 %	75 %	0 %	25 %	348027479
248	NC_016041	GTAC	2	8	12905	12912	25 %	25 %	25 %	25 %	348027479
249	NC_016041	T	6	6	12961	12966	0 %	100 %	0 %	0 %	348027479
250	NC_016041	ATA	2	6	13613	13618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348027480
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255	NC_016041	TCCTG	2	10	13843	13852	0 %	40 %	20 %	40 %	348027480
256	NC_016041	CTTGA	2	10	13892	13901	20 %	40 %	20 %	20 %	348027480
257	NC_016041	TCA	2	6	13958	13963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348027480
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259	NC_016041	CTT	2	6	13979	13984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348027480
260	NC_016041	GCC	2	6	13986	13991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348027480
261	NC_016041	TGC	2	6	14044	14049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348027480
262	NC_016041	GCAAAG	2	12	14152	14163	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	348027480
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264	NC_016041	T	6	6	14202	14207	0 %	100 %	0 %	0 %	348027480
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392	NC_016041	CGA	2	6	22204	22209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348027486
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497	NC_016041	TCA	3	9	28513	28521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348027493
498	NC_016041	CTCG	2	8	28569	28576	0 %	25 %	25 %	50 %	348027493
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